Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHMP2AO43633 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP2AO43633 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP2AO43633 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms