Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSTPIP1O43586 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSTPIP1O43586 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms