Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAP3K13O43283 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms