Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHD1O14646 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHD1O14646 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
CHD1O14646 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHD1O14646 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHD1O14646 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CHD1O14646 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHD1O14646 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHD1O14646 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CHD1O14646 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHD1O14646 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CHD1O14646 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHD1O14646 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CHD1O14646 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHD1O14646 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CHD1O14646 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CHD1O14646 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHD1O14646 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CHD1O14646 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CHD1O14646 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHD1O14646 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHD1O14646 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHD1O14646 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHD1O14646 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHD1O14646 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CHD1O14646 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CHD1O14646 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CHD1O14646 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CHD1O14646 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CHD1O14646 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CHD1O14646 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CHD1O14646 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
CHD1O14646 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHD1O14646 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHD1O14646 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHD1O14646 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CHD1O14646 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CHD1O14646 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHD1O14646 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHD1O14646 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CHD1O14646 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHD1O14646 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHD1O14646 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CHD1O14646 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHD1O14646 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHD1O14646 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHD1O14646 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHD1O14646 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHD1O14646 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CHD1O14646 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CHD1O14646 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms