Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms