Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX7O00628 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PEX7O00628 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX7O00628 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX7O00628 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX7O00628 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PEX7O00628 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PEX7O00628 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX7O00628 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX7O00628 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX7O00628 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX7O00628 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PEX7O00628 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX7O00628 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX7O00628 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX7O00628 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX7O00628 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PEX7O00628 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms