Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLRMTO00411 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLRMTO00411 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms