Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN8O00124 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms