Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
J3QKU1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QKU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QKU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
J3QKU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QKU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
J3QKU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QKU1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QKU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QKU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QKU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QKU1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QKU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms