Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms