Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP17L20D6RJB6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms