Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PP2D1A8MPX8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PP2D1A8MPX8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms