Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH2D7A6NKC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SH2D7A6NKC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms