Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC4A6NH21 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC4A6NH21 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms