Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GOLGA6CA6NDK9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GOLGA6CA6NDK9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms