Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM223A0PJW6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM223A0PJW6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms