Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1B0GVM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1B0GVM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms