Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0U1RRA0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0U1RRA0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms