Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X0T9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087X0T9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087X0T9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms