Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAV27A0A087WT01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAV27A0A087WT01 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms