Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRMT13Q9NUP7 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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