Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms