Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNA1SQ13698 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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