Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMTNP53814 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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