Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CTLA4P16410 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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CTLA4P16410 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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