Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNFSF9P41273 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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