Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RN7SL279P-201ENST00000582185 284 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ANGPTL7-201ENST00000376819 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms