Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSF1RP07333 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms