Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HMGB1P1B2RPK0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms