Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms