Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCAPH2Q6IBW4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms