Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2P78314 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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