Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ANXA3-209ENST00000512884 1335 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ZNF343-202ENST00000358413 771 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RPL10P12-201ENST00000427342 318 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC121247.1-201ENST00000622888 1232 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC006547.1-207ENST00000601746 930 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC006547.1-210ENST00000609644 589 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DYNLL1P2-201ENST00000554807 270 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC091153.4-201ENST00000570493 480 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 Metazoa_SRP.85-201ENST00000610909 260 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ATRXP46100 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ATRXP46100 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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