Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms