Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HBQ1P09105 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms