Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FREM3-201ENST00000329798 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms