Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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