Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms