Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms