Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MCMBPQ9BTE3 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms