Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SIRT1Q96EB6 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms