Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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RRN3P1Q2M238 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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RRN3P1Q2M238 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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RRN3P1Q2M238 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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