Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC3Q15034 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC3Q15034 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC3Q15034 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC3Q15034 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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