Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
IFITM1P13164 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms