Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM139Q8IV31 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms