Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
IMPG1Q17R60 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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