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| PTPRJ | Q12913 | SHANK2-202 | ENST00000357171 | 1373 nt | TSL 5 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FHL2-206 | ENST00000408995 | 1367 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EHMT2-202 | ENST00000375530 | 3856 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAPK14-202 | ENST00000229795 | 4319 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | REEP3-201 | ENST00000373758 | 5205 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HEPACAM-201 | ENST00000298251 | 3602 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PSIP1-203 | ENST00000380733 | 3391 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LMX1B-201 | ENST00000355497 | 5809 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UBE2I-204 | ENST00000397515 | 3109 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PDXDC1-218 | ENST00000627450 | 2683 nt | TSL 2 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STX1B-201 | ENST00000215095 | 4697 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC45A2-201 | ENST00000296589 | 1772 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UBOX5-AS1-201 | ENST00000446537 | 1792 nt | TSL 2 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX19B-208 | ENST00000563392 | 1760 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPU-226 | ENST00000640218 | 6858 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VPS36-207 | ENST00000611132 | 4607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NADK-202 | ENST00000341991 | 3098 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AHCY-205 | ENST00000538132 | 2366 nt | TSL 2 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF641-201 | ENST00000301042 | 4544 nt | TSL 5 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDT1-201 | ENST00000301019 | 3240 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ANKZF1-201 | ENST00000323348 | 2579 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DHX16-202 | ENST00000376442 | 3445 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SSTR1-201 | ENST00000267377 | 4295 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.67 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SERF2-206 | ENST00000409291 | 807 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STK16-203 | ENST00000409516 | 895 nt | TSL 2 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL161733.1-201 | ENST00000421067 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC019118.2-201 | ENST00000425776 | 718 nt | TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL137026.2-201 | ENST00000437014 | 841 nt | TSL 2 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | YPEL4-209 | ENST00000534711 | 889 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FOXN3-AS2-201 | ENST00000554071 | 1262 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC103808.5-201 | ENST00000577797 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC008687.7-203 | ENST00000598442 | 551 nt | TSL 4 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC090004.1-201 | ENST00000608606 | 653 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL136040.2-201 | ENST00000618431 | 1130 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC114296.1-204 | ENST00000637197 | 1173 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KRT17P5-203 | ENST00000445433 | 2333 nt | TSL 2 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MKRN5P-201 | ENST00000445263 | 1467 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DDX21-202 | ENST00000620315 | 4829 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VMP1-201 | ENST00000262291 | 2712 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KDM8-212 | ENST00000568965 | 1655 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GOLIM4-202 | ENST00000470487 | 4373 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP003969.2-201 | ENST00000623739 | 2275 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TTC7A-202 | ENST00000394850 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ACTR2-205 | ENST00000542850 | 1429 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HAND2-AS1-202 | ENST00000502896 | 5278 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRIT1-202 | ENST00000372818 | 2034 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ACTG1-206 | ENST00000573283 | 2002 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAN2B1-203 | ENST00000456935 | 3184 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01679-201 | ENST00000442815 | 2798 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC7A9-201 | ENST00000023064 | 1761 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TCL1A-201 | ENST00000402399 | 1395 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PDPK1-202 | ENST00000342085 | 7241 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP4B1-201 | ENST00000256658 | 2742 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IRAK1-203 | ENST00000369980 | 3666 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HPGD-204 | ENST00000504433 | 1910 nt | TSL 2 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | MRPS9-201 | ENST00000258455 | 1500 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ELOA-204 | ENST00000613537 | 4924 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNIK-202 | ENST00000341852 | 4727 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC115284.2-201 | ENST00000624646 | 2054 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | POLG-201 | ENST00000268124 | 4500 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C8orf31-201 | ENST00000395172 | 1875 nt | TSL 2 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARHGAP45-206 | ENST00000586866 | 4120 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DHX36-213 | ENST00000496811 | 6733 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZSCAN32-202 | ENST00000396846 | 3173 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ADD1-207 | ENST00000446856 | 3745 nt | TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DRD2-204 | ENST00000538967 | 1493 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RBM22P2-201 | ENST00000393978 | 1814 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PIGL-201 | ENST00000225609 | 1137 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | U3.5-201 | ENST00000363448 | 216 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WASIR1-201 | ENST00000399966 | 1054 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ID2-AS1-201 | ENST00000412712 | 953 nt | TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001057.1-201 | ENST00000437557 | 799 nt | TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IZUMO1R-202 | ENST00000440961 | 805 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIATNB-206 | ENST00000444388 | 918 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ESRRAP2-203 | ENST00000453309 | 822 nt | TSL 5 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC084752.1-201 | ENST00000509766 | 622 nt | BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC246817.2-203 | ENST00000517357 | 569 nt | TSL 4 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC111149.2-202 | ENST00000518355 | 599 nt | TSL 4 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC246817.2-202 | ENST00000519393 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FXYD6-202 | ENST00000524656 | 1033 nt | APPRIS P2 TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EHF-208 | ENST00000530286 | 1280 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DUXAP9-201 | ENST00000547220 | 665 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CRTC3-AS1-202 | ENST00000559531 | 657 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC018761.2-201 | ENST00000585496 | 296 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC007998.2-201 | ENST00000589258 | 455 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IRF3-225 | ENST00000600022 | 882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FXYD3-204 | ENST00000603181 | 758 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL137793.2-201 | ENST00000632635 | 659 nt | TSL 3 BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NDRG4-236 | ENST00000566192 | 3265 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNF44-201 | ENST00000274811 | 4155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.66 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CLEC10A-202 | ENST00000416562 | 1646 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRMT5-202 | ENST00000324366 | 2531 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ADAM15-202 | ENST00000355956 | 2877 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HTR3A-201 | ENST00000299961 | 1994 nt | TSL 2 BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NYNRIN-201 | ENST00000382554 | 7857 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ITGB1BP1-201 | ENST00000238091 | 1772 nt | TSL 3 BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC00846-201 | ENST00000334165 | 1778 nt | TSL 2 BASIC | 14.65 | □□□□□ -0.06 | | |