Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms