Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 459.1 ms