Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP2O75323 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms